Deniz Seki, mahkumiyetinin hukuka aykırı yöntemlerle elde edilen delillere dayandırılması, tanıkların dinlenmemesi ve ayrıca kovuşturmanın kaldırılan mahkemelerce yapılması nedeniyle adil yargılanma hakkının ihlal edildiğini ileri sürerek, AYM’ye bireysel başvuruda bulunmuştu. AYM, Seki'nin başvurusundaki kanuni hakim güvencesi ve tanık sorgulama hakkı ile delillerin elde edilmesi ve değerlendirilmesinin adil olmadığı iddiasını "açıkça dayanaktan yoksun olması" nedeniyle başvurunun kabul edilemez olduğuna karar verildi.